El edificio del antiguo Hospital de Nuestra Señora de la Concepción es un magnífico ejemplo de hospital del siglo XVI. Fue fundado, por el rico mercader burgalés Diego de Bernuy, en 1565 para atender a los pobres de la ciudad. Levantado a partir de 1552, fue el primer hospital de corte moderno que tuvo Burgos. Su portada es el resultado de una ampliación posterior, realizada en el siglo XVII.
En 1799 se instaló en el edificio el Real Colegio de Medicina y Cirugía que fue suprimido en 1824. En el siglo XIX tuvo, durante algún tiempo, usos militares.
Para los próximos años se ha previsto una transformación de este edificio, que pasará a formar parte de la Universidad de Burgos y compartirá espacio con el Archivo Histórico Provincial.
